Un CRM con facturación es una herramienta que, además de gestionar clientes y oportunidades, emite facturas, presupuestos y albaranes desde la misma ficha del cliente. Para una pyme o un autónomo, la ventaja es que no tiene que copiar datos entre el CRM y el programa de facturación. Flowgration incluye facturas, rectificativas, proformas, presupuestos, albaranes con firma y registros preparados para Verifactu, junto con el CRM.
Tres tipos de herramienta que se llaman "CRM con facturación"
Conviene distinguir antes de comparar, porque no todas cubren lo mismo:
| Tipo | Ejemplos (nuestro estudio, noviembre de 2026) | Qué resuelve bien | Qué deja fuera |
|---|---|---|---|
| Software de facturación | Billin, Quipu, Contasimple | Facturas, presupuestos y albaranes | Seguimiento comercial y automatización de clientes |
| ERP con facturación | Holded | Facturación, contabilidad y RR. HH. en una suite | Es más amplio de lo que necesita quien solo quiere vender y facturar |
| CRM con facturación | Flowgration | Clientes, oportunidades, automatización y facturación en la misma ficha | Contabilidad de partida doble, modelos 303 y 390, banco y nóminas |
Según nuestro estudio, los planes de facturación de Billin rondan los 8 a 28 € al mes, Quipu los 17 a 59 € y Contasimple entre 0 y unos 20 €. Holded va de 19 a 229 € al mes, sin IVA. Son precios aproximados: consulta la web de cada proveedor.
Qué debe hacer un CRM con facturación
Cuando compares, revisa estos puntos en la demo y no solo en la página de precios:
- Series de facturación y numeración correlativa, con las series que necesites para tu negocio.
- IVA, recargo de equivalencia e IRPF cuando apliquen a tu actividad.
- Facturas rectificativas con referencia a la factura original y motivo.
- Proformas y presupuestos que se conviertan en pedido o factura sin volver a escribir datos.
- PDF con tu logo y envío por email desde la herramienta.
- Cobros y vencimientos, con cobros parciales y aviso de impagados.
- Exportación del registro de facturas emitidas en Excel o CSV para tu gestoría.
- Facturación de pedidos de tienda en un clic o de forma automática.
Verifactu: qué significa para tu CRM
Verifactu es el sistema de la Agencia Tributaria para que el software de facturación genere registros verificables. En términos prácticos, cada factura queda registrada de forma encadenada con la anterior mediante una huella digital, y debe llevar un código QR. El software que uses tiene que cumplir esos requisitos.
Las fechas están en revisión. A noviembre de 2026 se ha anunciado un nuevo aplazamiento a octubre de 2028, pero no estaba publicado en el BOE en el momento de escribir esto. Por eso, no decidas solo por la fecha: confírmala con tu gestoría o con la Agencia Tributaria.
Flowgration genera registros encadenados con huella SHA-256 y código QR, y está preparado para Verifactu. Eso no significa que esté homologado ni certificado por la Agencia Tributaria. Pregunta a tu gestoría qué modalidad le conviene a tu caso.
Cómo elegir un CRM con facturación
- Haz la lista de documentos que emites hoy: facturas, rectificativas, presupuestos, albaranes y proformas.
- Pide que te muestren el flujo completo: desde un presupuesto aceptado hasta el cobro de la factura.
- Pregunta por la exportación del libro de facturas emitidas y el formato que entrega.
- Comprueba qué pasa con los pedidos si vendes online: ¿se factura solo una vez?
- Revisa el coste a 12 meses con tu número de usuarios y de facturas.
- Confirma qué no hace la herramienta. Es tan importante como lo que sí hace.
Lo que Flowgration incluye en facturación
- Facturas, facturas rectificativas y proformas, con series y vencimientos.
- Presupuestos (con aceptación online mediante firma electrónica), pedidos de venta y albaranes con firma, con el flujo presupuesto, pedido, albarán y factura.
- Cobro online de facturas con tarjeta en tu propia cuenta de Stripe, y facturas recurrentes.
- Facturar un pedido de la tienda con un clic o automáticamente desde un journey. Cada pedido solo se factura una vez.
- Disparadores de automatización cuando una factura se emite, se paga o vence, o cuando se acepta un presupuesto.
- Tesorería con cobros y pagos, cobros parciales y previsión.
- Exportación del registro de facturas emitidas para la gestoría.
- Importación de clientes desde Holded con una clave API.
Lo que Flowgration no hace
Esta parte es importante para no comprar lo que no encaja:
- Contabilidad de partida doble.
- Modelos 303 y 390.
- Conexión bancaria.
- Nóminas y remesas SEPA.
- TicketBAI.
La contabilidad y los modelos fiscales siguen en manos de tu gestoría. Flowgration le entrega el libro de facturas en Excel o CSV.
Para quién es y para quién no
Encaja con: autónomos y pymes de servicios que emiten facturas y quieren seguimiento de clientes en el mismo sitio, y tiendas online que facturan pedidos.
No encaja con: empresas que necesitan contabilidad completa dentro de la misma herramienta, empresas con banca integrada o nóminas, y quien necesita TicketBAI.